Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC38A4Q969I6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC38A4Q969I6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC38A4Q969I6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms