Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-CQ95604 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-CQ95604 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HLA-CQ95604 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms