Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP2A3Q93084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP2A3Q93084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP2A3Q93084 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms