Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTPRN2Q92932 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPRN2Q92932 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRN2Q92932 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms