Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA4DQ92854 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA4DQ92854 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA4DQ92854 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms