Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
PTPRUQ92729 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PTPRUQ92729 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PTPRUQ92729 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PTPRUQ92729 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms