Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
DHX38Q92620 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DHX38Q92620 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DHX38Q92620 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX38Q92620 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
DHX38Q92620 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms