Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AP3S1Q92572 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AP3S1Q92572 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AP3S1Q92572 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms