Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM3CQ92520 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FAM3CQ92520 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM3CQ92520 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms