Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STAG1Q8WVM7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
STAG1Q8WVM7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
STAG1Q8WVM7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
STAG1Q8WVM7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms