Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CCDC107Q8WV48 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC107Q8WV48 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms