Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC40.05■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.04■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.01■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
TRIM41Q8WV44 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
TRIM41Q8WV44 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC39.91■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
TRIM41Q8WV44 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC39.84■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
TRIM41Q8WV44 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms