Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HDAC7Q8WUI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HDAC7Q8WUI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 540 ms