Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC05

MDM1, Nuclear protein MDM1, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM1Q8TC05 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MDM1Q8TC05 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MDM1Q8TC05 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MDM1Q8TC05 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms