Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEDD1Q8NHV4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NEDD1Q8NHV4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NEDD1Q8NHV4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms