Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID1BQ8NFD5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARID1BQ8NFD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARID1BQ8NFD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms