Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SPATA4Q8NEY3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPATA4Q8NEY3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPATA4Q8NEY3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms