Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPFIBP2Q8ND30 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIBP2Q8ND30 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPFIBP2Q8ND30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms