Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDPRQ8NCN5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDPRQ8NCN5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms