Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PNLDC1Q8NA58 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PNLDC1Q8NA58 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms