Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC63Q8NA47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC63Q8NA47 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC63Q8NA47 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms