Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFSD2AQ8NA29 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFSD2AQ8NA29 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MFSD2AQ8NA29 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms