Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FSIP1Q8NA03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FSIP1Q8NA03 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms