Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM71DQ8N9W8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM71DQ8N9W8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM71DQ8N9W8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
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