Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRC57Q8N9N7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC57Q8N9N7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC57Q8N9N7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms