Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC89Q8N998 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC89Q8N998 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC89Q8N998 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms