Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA1Q8N8W4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNPLA1Q8N8W4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA1Q8N8W4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms