Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SAMD12Q8N8I0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SAMD12Q8N8I0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms