Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RNF148Q8N7C7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RNF148Q8N7C7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF148Q8N7C7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms