Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7B9

EFCAB3, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB3Q8N7B9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFCAB3Q8N7B9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFCAB3Q8N7B9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms