Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5S9

CAMKK1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK1Q8N5S9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAMKK1Q8N5S9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAMKK1Q8N5S9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAMKK1Q8N5S9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms