Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PHTF2Q8N3S3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PHTF2Q8N3S3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PHTF2Q8N3S3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms