Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y7

PGAM4, Probable phosphoglycerate mutase 4, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM4Q8N0Y7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGAM4Q8N0Y7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGAM4Q8N0Y7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGAM4Q8N0Y7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms