Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0S2

SYCE1, Synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1Q8N0S2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SYCE1Q8N0S2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYCE1Q8N0S2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYCE1Q8N0S2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms