Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RPAP2Q8IXW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RPAP2Q8IXW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms