Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOT1Q8IXI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RHOT1Q8IXI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOT1Q8IXI2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RHOT1Q8IXI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms