Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ4

TRIM48, Tripartite motif-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM48Q8IWZ4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM48Q8IWZ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM48Q8IWZ4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM48Q8IWZ4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms