Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RIOX2Q8IUF8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RIOX2Q8IUF8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIOX2Q8IUF8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms