Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK7

VSIG1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG1Q86XK7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSIG1Q86XK7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSIG1Q86XK7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSIG1Q86XK7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms