Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLC51AQ86UW1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLC51AQ86UW1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLC51AQ86UW1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms