Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDZD3Q86UT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZD3Q86UT5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms