Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNX20Q7Z614 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNX20Q7Z614 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNX20Q7Z614 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms