Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BRAPQ7Z569 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BRAPQ7Z569 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRAPQ7Z569 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms