Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM46Q7Z4K8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM46Q7Z4K8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM46Q7Z4K8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.2 ms