Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX9Q7RTT3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SSX9Q7RTT3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSX9Q7RTT3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms