Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTOP2Q7RTS6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTOP2Q7RTS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTOP2Q7RTS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms