Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
OTOP3Q7RTS5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
OTOP3Q7RTS5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
OTOP3Q7RTS5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms