Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HS2ST1Q7LGA3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HS2ST1Q7LGA3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HS2ST1Q7LGA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HS2ST1Q7LGA3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms