Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT2Q7L5N7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LPCAT2Q7L5N7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT2Q7L5N7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms