Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC80Q76M96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC80Q76M96 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC80Q76M96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms